淘客熙熙

主题:寰球同此凉热 -- 本嘉明

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家园 引用一家的说法

“武汉病毒”或许是经过人工修改的,目前有两个疑点。

第一个,哈佛等学校的学者已经指出了:多出1378对非天然的碱基对。

第二个,印度研究人员指出的所谓“S蛋白接入了艾滋病毒的DNA”,后来印度作者把文章撤回了。

《文学城》网站(这个网站是台湾裔美国人在美国运营的)有位博主 “马可安”解释了这两点,我把他的博文简化一下,捋一遍。我本人不是学这个专业的,不敢说对错。

首先,在海外的朋友,可以用 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947 来查询各种病毒的蛋白质和核酸序列数据,这个MN908947 就是武汉肺炎病毒的编号。

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武汉肺炎病毒,与一种 “舟山蝙蝠冠状病毒“(bat-SL-CoVZC45:MG772933),最为接近。这个病毒的核酸序列数据是于2018年1月5日,由南京军事医学院提交到这个国际数据库的。

武汉病毒和舟山病毒,大约有89.12%相似度;而武汉病毒和2003年的非典病毒,则仅有82.34%的近似度。可是最令人惊异的是,武汉和舟山,这两者的E蛋白完全相符,各自有75个相同的氨基酸。

假如单独拿出S蛋白比较,武汉病毒和舟山病毒仅有81%的相似度。而且中间有四小段插入片段,是武汉病毒的S蛋白独有,舟山病毒S蛋白没有的。这4个插入,就是印度学者质疑的人工插入物。

比较武汉病毒和舟山病毒的核酸序列,发现有一大段是舟山病毒没有而武汉病毒被插进去的(21697-23074,长度1378个碱基对)。

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上图:红色部分,就是武汉病毒里那多出来的1378长度。

从业学者搜寻比对不同病毒的蛋白质和核酸序列,可以用一个叫“BLAST”的网上工具https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi ,可以在蛋白质或核酸的页面右侧点击Run Blast。运行BLAST的时候,在空框输入具体搜寻的部位数据。

用BLAST搜索这段1378长度的插入核酸,找不到天然类似的来源。可是它会找到一个匹配对象,就是中国科学家在1980年代做的pShuttle-SN,核酸编号为AY862402。

这些结果表明,“武汉病毒”,有一点可能,是以 “舟山病毒”为素材,人工插入一段1378长度的核酸而合成的。

再说说“云南蝙蝠病毒”是怎么回事。这个云南蝙蝠病毒据称是2013年被石正丽团队采集到的,编号MN996532。它和武汉病毒相似度96%,和舟山病毒的相似度仅89%,尤其是它的S蛋白,可以解释武汉病毒里S蛋白的那四个可疑插入物是自然形成,不是人工产物。可是最大的问题是,它是印度科学家即将发表论文声称武汉病毒S蛋白含有艾滋病毒插入物(就是这4个插入物)之前,由武汉病毒研究所在2020年1月27日火速递交的数据,随后印度方面就撤稿了。武汉所递交的时间点有点不同寻常。

最后,马可安从微生物演化树的角度分析:

点看全图

上图里,多数分叉都可以几乎100%溯源,知道蛋白或核酸的序列来自哪个自然界的祖先,可是武汉病毒分叉的溯源率仅76%,有24%的东西讲不清楚血统。

通宝推:逍遥蜀客,
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