淘客熙熙

主题:【原创】胰岛素传奇 -- 爱莲

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            • 家园 施一公,功夫了得,是清华运动会某年的竞走冠军

              在一个剪报上看的,1988级,算老8字班的.

            • 家园 蛋白质晶体结构分析

              说白了,就是一个辅助手段。跟基因组计划很相似,虽然这个手段在很多时候非常有用。尤其是在大分子相互作用分析的时候。妖道因为要用到,所知道一点点。我并没有瞧不起的意思,但是这个方向很有意思,也就是仅此而已。

              • 家园 我倒觉得晶体结构解析是最重要的工具

                说它是辅助手段不假,是因为还远不成熟的原因吧。

                它也是基因组计划之后的主要目标和手段之一,当然还有

                NMR,电镜,中子反射之类的。

                资助结构研究的很多是药厂,意义要说深远也不为过的。

                • 家园 重要性是有的,最重要么?

                  分析一个蛋白质的作用,分几个层次:活体水平、细胞水平、生化水平,最后才是分子水平。晶体结构解析,说来不过是分子水平的一个手段而已,还是体外的,有着这样那样的局限性,尤其是蛋白质结晶基本上都是在蛋白质处于非正常生理性结构情况下获得的。而同样研究目的的核磁共振,获得的是生理状态下的蛋白质结构。

                  在活体内跟其他基因的相互作用,还是要靠遗传来获得;细胞内的定位和作用,还要用细胞生物学的手段来研究,蛋白质分子间的直接结合和相互作用,还是要靠生化的法子来确定;没有了这些,解出的结构就基本上是一无是处。

                  药厂资助的,大都是前期研究已经非常成熟的蛋白质,只差最后这一步而已。要说深远的意义,那是对于药厂的利益而言。对于整个生物学发展的大势,没有多大的影响,更谈不上什么深远。

                  • 家园 既然只差最后一步,当然就是最重要的了

                    前期研究成熟的都是用已经有的那些你提到过的方法;

                    最后差一步,才显得重要。

                    生物学发展的大势不能演化成提高健康水准的产品,似乎

                    有孤芳自赏的嫌疑。

                    生物化学的方法,有最多需要的有最深刻意义的,就是最

                    重要的;排除那些写入教科书的不提,有需要而不成熟的

                    技术,是所谓最 重要 的东西。

                    至于非正常生理性结构情况下获得的蛋白质结晶,我咨询过

                    专家啊,他说 这根本不是问题。

                    因为结晶所以有活性,因为完整所以结晶。

                    • 家园 呵呵

                      换个问法,如果我们不知道最后的晶体结构,那么我们所了解的东西就不能演化成提高健康水准的产品么?那么80年代之前,我们所有的制药业所生产的产品都是瞎蒙胡凑出来的了?美国FDA已经批准的药物里面,又有几个是通过了解了晶体结构做出来的?

                      很遗憾,即使前期工作做得很好,蛋白质晶体结构也只不过是制药行业的一个辅助手段。所得到的,只是理论上的可能性,具体的可行性,还要回到那些写入教科书的古老手段来完成。晶体结构所作的,只不过是把周期缩短了一点,把效率提高了一点,把钱节省了一点。而这些,与科学研究大多无关。

                      结晶蛋白,并不一定就是完整的肽链,也并不是所有的结晶都有活性。所以,非正常生理性结构情况下获得的蛋白质结晶,有没有问题,要具体问题具体分析来看。

                      • 呵呵
                        家园 agree
                      • 呵呵
                        家园 agree
                      • 呵呵
                        家园 看来您对这个问题不够重视阿

                        对,80年代之前中国的药物基本上是大运给撞得;

                        (举例,就说发现云南白药的那条线索是一条断腿

                        的狗,不知道是不是真的)

                        晶体结构的好处是很多的,很肤浅的一层就是直观

                        可靠,符合很多人眼见为实的思想。

                        科研难道不讲究效率高一点,钱节省一点,周期短一点

                        毕竟实验室都不是喝风的:)

                        写入教科书的那些,当然好,多少人的性命换来的;

                        但是不保持对新方法的敏感性和主动支持,恐怕还不是一个

                        好的领导.....

                        我感觉,FDA批准的那么少,跟结构研究不成熟关系甚

                        • 家园 没有说不重要

                          只不过,不能说最重要。

                          晶体结构研究目前还是个很烧钱的领域。通常一个实验室,至少有几十个,甚至几百个,蛋白质结晶在同时进行。什么时候能够得到结晶,这个可就全看人品和运气了。对于制药行业来说,这点钱不算什么,因为人家一个药品的投资都是按照几亿美元来算的。但是对于普通的科学研究来说,是根本不可企及的。所以,目前的蛋白质结晶研究,只在有数的一些实验室里面进行,不可能推而广之。科研的确是要讲究效率,节省金钱和时间。但是,这些恰好不是蛋白质结晶研究的长处,而正是其短处。

                          FDA之所以批准的少,不是因为晶体研究的层次不够,而是因为对于其他层次的研究还不够。晶体研究能够你带来的信息,就是那么多,这是研究层次所决定的。

                          反观晶体研究的重大成果,大都是因为深入了一个新的层次,观察到了以前观察不到,或者观察不了的一些现象,而这些新的观察,一定要回到细胞层次,或者更高层次去得到证实,才能够发表出来。单纯的晶体结构研究,只有技术层面的意义,很多甚至连技术层面都算不上了。

                          总而言之,不能人为的割裂各个研究层次之间的联系,夸大某一层次的重要性。每一个层面都是重要的,虽然目前的瓶颈大都在结构方面,但是你不能说结构研究最重要。

                          你不是施一公的学生吧?

                          • 家园 晶体结构还是很重要的,不过

                            要是说最重要的,在生物学里估计能列出来几十个,例如偶们的脑袋算不算最重要的,有人搞清了学习和记忆机理了吗?更不要说意识与情感了,估计想多了,自己就先疯了。

                            不过有了晶体结构,就可以拿机器算了,MD一定程度上还是可信的,配合上一些实验结果,也能说明点儿问题。PDB里面只有几万个结构,很多还是redundant,所以做Xray的同学们还是任重道远呀。而且有些冬冬确实难搞,像膜上的几乎做不了,要不怎么那么多人在predict structure呢?不过好像要是没有好的template,大家只好猜了。但这东西一般要是听搞数学的,那就祈求上天保佑吧,还是那帮生物科班的有点儿谱

                            楼上说得这几个,什么饶同学,施同学,好像都给青蛙有些关系嘛,难道那地方儿盛产Xray爱好者?

                          • 家园 估计不是

                            他的学生哪有空上网,如果是的话,敬礼敬佩!

                            • 家园 回礼,回礼...他的学生一定比我用功.

                              过去没有这份运气领受他的教诲...

                              结晶看人品和运气,此话千真万确....另外还有能烧钱。。

                              我也就是一个烧灶的...

                              公司目前并不依赖晶体结构信息,计算加大规模的筛选,

                              差不多够用,投资一个结构,时间成本非常高;具体作的

                              人接手,风险也不小,非常烧 运气和人品 ...

                              眼下对晶体结构的要求,水涨船高,出版教科书的出版商

                              也都等着呢。

                            • 家园 啊哈,抓到你了

                              怎么在上班时间写东西?扣那个通宝两枚,回头交给我就行了。

                              • 家园 你这个马甲也太不咋的了

                                叫人一眼就看穿了

                                给你出个题:1+1=1,有没有时间做?

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