淘客熙熙

主题:【讨论】NIH的新老大在21号的S上说 -- 喜欢喝冰茶

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                      • 家园 童鞋,开公司的不这么写

                        那还不天天打官司?

                        Illumina只是提供一个技术平台,你让它干这个,就它那点儿后期分析的本事,收你50k都是少的。干这事找它算是上了鬼子的当了。

                      • 家园 哈哈,这个你就理解错了

                        根据权威人士透露,$50000是测整个genome,不是只测某些致病基因,以后还会更便宜。

                        另外不是不保证数据准确性,而是不对基因做出解释。

                        • 家园 花了几十亿的genome到现在还有空白区测不出

                          50000就敢保证测全整个?看来你说的权威人士水平也不过如此。对这种东西我根本就不需要去理解公司广告是怎么说的,我和干这个的某个老板隔个礼拜就开个会,对于临床基因诊断的现状和前景我还是很清楚的。以现在的技术水平来说,用这种价钱得出来的数据会有无数的N,如果你是学这行的,应该明白N是什么意思。另外illumina已经点明了他们的数据只提供probability,而不是deterministic data,这才是整个噱头里的点睛之笔,这种级别的数据看看为数不多的几个研究很透彻的基因,例如brca,有没有突变还可以,但担保准确测出20000个基因,那是胡扯。

                          • 家园 不和你争

                            我不是学这个的,不过刚才有个在ilmn待了很多年的专业人士是这么说的。

                            现在她不在,我就不说了,,,

                            • 家园 吼吼,原来是illum内部人士

                              她的chip那么灵,赶明我和那个老板提一下,外包他们公司测2个致病基因的序列,全美几十万的病人,一个就算10000美元吧,几十个billion的单子,看illum有没有信心接,这不过是2个基因,比起20000个基因的genome来那应该容易的多吧。

                              话说回来,测序的能力现在肯定没问题,大问题是如何快速廉价准确的测全genome,但目前的next generation re-sequencing 还不能保证这个目标,很多难测的区域要反复测,甚至专门设计新的chip来测,这个成本一下子就翻番了;

                              另外一个大问题是参考数据严重缺乏,我提到的那个实验室在测病人基因是,经常发现几十个未报道的SNP,你也不知道那些是致病点,那些不是,要确定,就必须把病人的七大姑八大姨的基因再测一遍,这花费就海了,现在他们专门建了一个数据库,就是针对那几个基因的,慢慢来,估计5到10年后能有起色,但这是全美排前的遗传病才能有资金这么干,其他数以千计的小遗传病的信息收集是要花费几代人的精力的,而且50%以上的遗传病到现在连致病基因都没有发现。

    • 家园 河里不是上次讨论过么?

      好像这个测序没啥实际用途,目前。。。

      • 家园 诊断啊,治疗现在是没戏

        现在就挣钱了,那就不叫潜力股了。现在Illumina挺不错的,可Affy当老大的时候,有几个敢投Illumina的?

        话说这老大还没坐上老大的宝座时,还是堂主或者香主的时候,曾经测过自己的Genome,好像是解释互相矛盾,这不当了老大这开始折腾这块儿了。NIH的老大好像是有一些机动资金的,可以专门针对某些项目发钱。虽说没有DOE和军方那么拽,可NIH也不穷不是。这不刚上任就说10多个billion的stimulus funding不够,要36个billion才行,好像申请的也才2w多,一个RO1才多少钱了?

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